Este Departamento coordina los programas educativos de Ingeniería Biomédica e Ingeniería en Energías Renovables; además administra los laboratorios del Taller de Ingeniería Biomédica. El Departamento como unidad orgánica básica agrupa profesores e investigadores responsables de la docencia, la investigación y la extensión en los campos de la Medicina, Fisiología e Instrumentación biométrica, así como el aprovechamiento de recursos renovables en la generación alterna de energía, eficiencia energética industrial y combustibles alternos.